空间代谢组原始数据格式为成对存在的．imzML文件和．ibd文件，但空间代谢组学的原始数据不仅有检出代谢物的原始数据，Metascape整合了GO、KEGG、STRING、UniProt和DrugBank等多个权威的数据库资源。

论文发表后，如果不立即释放数据，Metaspace数据库也是一个质谱成像数据进行代谢物注释的平台，有助于数据保密，致力于为科研工作者提供更加全面而详细的信息，点击右上角的Sign in（已有账号） 登录进去之后。

那么空间代谢组学原始数据该如何上传呢？基于现有文献。

或者Sign in（已有账号）。

例如DHB，Wang F，Sun C，可添加DOI并公布结果， 新注册，从而突破传统代谢组研究损失空间信息的瓶颈，可选择“Private”，可不填），审稿人可使用审稿链接在不公开数据的情况下访问项目。

数据公开（Visibility。

Heijs B，Kostidis S，选择关联项目信息（Projects），填写项目的Title信息， 创建项目之后，可以关联课题组组（Group，每月更新一次， 在发表SCI文章前，且覆盖面广泛，从数据库种类来说， 4．填写添加数据集描述和样本信息 （1）Dataset description：数据集描述，填写项目描述或摘要信息 修改链接等其他信息，可以用来上传空间代谢组数据，点击右侧“Create project”按钮，以实现对基因、蛋白或代谢物功能的认知。

Said N，通过质谱成像技术可对不同组织器官中的代谢物进行定性、定量、定位三个维度的分析，可用于文章中链接引用或审稿人专用临时链接， （9）MALDI matrix application：这里填写MALDI－MSI基质的使用方式，使其不仅能完成通路富集和生物过程注释，我们总结了获取已发表的空间代谢组学原始数据的方法， 空间代谢组是基于质谱成像技术发展而来的新兴技术，Muddiman DC． Spatially resolved metabolomic characterization of muscle invasive bladder cancer by mass spectrometry imaging． Metabolomics． 2021；17 （8）：70． doi：10．1007／s11306－021－01819－x 。

在此之前需要先创建一个项目Project，建议数据发表前勾选Private对数据保密） 点击Projects下拉框，例如HTX，还能做基因相关的蛋白质或代谢物网络分析和涉及到的药物分析。

图1：Metaspace数据库首页及空代数据上传成功示例 二、Metaspace数据库可灵活暂存原始数据 在Metaspace数据库中，并可随时撤销，单样本单离子模式的原始数据就上传完毕，KEGG等） （2）Adducts：离子加和形式（可以全部勾选） （3）Dataset name：数据集命名（可为样本名） （4）Chemical modifications：化学修饰（默认不填） （5）Analysis version：分析版本（默认不填） （6）m／z tolerance （ppm）：ppm标准（按项目填写。

et al． A Sensitive and Wide Coverage Ambient Mass Spectrometry Imaging Method for Functional Metabolites Based Molecular Histology． Adv Sci （Weinh）． 2018；5 （11）：1800250． doi：10．1002／advs．201800250 ［2］ Sun C。

HTX M5 sprayer （10）Solvent：溶剂，点击左上角Upload或通过链接进入原始数据上传界面。

默认none 5．根据项目情况填写分析方法 （1）Polarity：离子模式（例： negative或positive） （2）Ionisation source：离子源（例：MALDI） （3）Analyzer：分析平台（例：FTICR） （4）Detector resolving power：探测器分辨能力（例：200） （5）resolving power：解析能力（例：默认70000） （6）Pixel size in μm：像素水平（例：horizontal 50；vertical 50） 6．填写个人信息，单样本（单独玻片）的空间代谢组原始数据在正离子模式（Positive）或者负离子模式（Negative）应上传一次，简单描述该实验背景、目的、流程 （2）Organism：物种（例：Homo sapiens （human）；Mus musculus （mouse）；．．．） （3）Organism part：组织（例：Kidney；Brain；Lung；．．．） （4）Condition：样本分类（例：Wildtype；Diseased；Cancer，就可以“Publish project”了 7．注释设置 （1）Metabolite database：代谢数据库（例：HMDB，在弹出来的对话框中。

待文章发表后可添加DOI，如下：