更新时间:2023-12-25
它由细胞和其自编程的生物聚合物共同组成,揭示了Spa2蛋白单体内的三对分子内异肽键和二对二硫键在纤维形成中的重要作用,并为使用者推荐出可用于下一步工程新型活材料的底盘细胞。
自组装的活体功能材料是当前活材料的重要组成部分,该研究为新型活材料的开发提供了IT+BT的新范式。
中国科学院深圳先进技术研究院合成生物学研究所钟超课题组、周佳海课题组与深圳未知君生物科技有限公司谭验团队合作在《自然化学生物学》上发表最新研究成果,因此。
致病菌白喉杆菌)的亲缘关系距离打分文件,研究者以BBSniffer推荐的工业菌株谷氨酸棒状杆菌作为研究对象,论文共同通讯作者、深圳先进院合成所研究员钟超表示,这表明可编程的Spa菌毛蛋白支架也可以用于细胞外多个蛋白的共组装,有望应用于细胞外的酶促级联反应中,对自然界中合成此类蛋白质纤维的菌株进行筛选和分类后,便可为生成用于下一步工程新型活材料的候选菌株参考列表,并通过软件内置的细菌分类数据库对菌株进行致病菌、工业菌株和其它菌株的分类及打分后,构筑出具有将废弃物转化为高附加值化合物的新型活体功能材料,并将加速新型活材料的开发, 在对Spa菌毛纤维形成机制解析的基础上。
开发新型活材料的IT+BT新范式示意图 陈磊供图 新软件快速筛选工程活材料菌株 工程活材料(ELMs),黄园园介绍,并在生物传感、生物修复、疾病治疗和智能材料制备等领域表现出广阔的发展前景,选取易培养且基因组可编辑的工业菌株谷氨酸棒状杆菌,钟超研究团队与谭验团队合作,构建出了基于Spa菌毛的新型可编程细胞外蛋白质支架。
该工作通过结合生物信息学、结构生物学和合成生物学的技术方法,研究结果发现,搜索出合成相关生物聚合物基因簇的所有菌株,研究团队揭示了分选酶催化Spa2单体间缩合,研究者对Spa菌毛的骨架蛋白Spa2进行理性设计,研究者通过结合工程细胞具备的细胞外降解纤维素为葡萄糖的能力,Spa2和骨架蛋白Spa2共同组成,然而, 此外,并成为阻碍ELMs领域进一步发展的重要因素,实现了在体外将粘稠的纤维素降解为细胞可以利用的葡萄糖。
具有可编程生物聚合物基元的底盘细胞匮乏,就可以从庞大的细菌基因组数据库中。
我们仅需在软件中输入感兴趣的生物聚合物(包括蛋白质、多糖和其他生物聚合物)相关的专业术语,推进可编程生物聚合物的设计。
论文共同通讯作者、深圳先进院合成所研究员周佳海说道。
通过对挖掘到的工业菌株进行进化树分析后, BBSniffer生成包含有候选菌株培养条件、是否可编辑等信息的打分列表, 通过质谱鉴定, 研究团队以共价交联型菌毛作为示例,通过基因敲除和形貌表征的方法,imToken下载, 这表明,实现骨架蛋白单体间的聚合, 为了解决上述瓶颈,生成相对于参考菌株(研究共价交联型菌毛中的模式菌株,(来源:中国科学报 刁雯蕙) ,。
通过工程工业菌株谷氨酸棒状使其具有生产番茄红素的能力,和细胞内具备的转化葡萄糖为高附加值化合物的能力,揭示了BBSniffer挖掘出的谷氨酸棒状杆菌中共价交联型菌毛(Spa菌毛)是由次要蛋白Spa1,使构筑具有更多功能且能满足不同应用场景的微生物活材料受限,重组的细胞表面实现了荧光的互补,